После постройки в 1604 г. Томского острога русские землепроходцы столкнулись с "киргисскими мужыками" - предками хакасов. Киргисская землица, или улусы енисейских кыргызов представляли собой раннегосударственное образование, состоявшее из 4 улусов ("государств"). Древнее наименование - Хонгорай (Хоорай) - так до сих пор шорцы именую хакасов. Население Кыргызской землицы существовало в рамках родовой и раннеполитической систем. Роды-сеоки (от сёёк - "кость") делились на хасках сёёк (белые, т.е. аристократические) и пора сёёк (серые, незнатные, куда входили и кыштымы-данники). Представители белых родов именовались также чайзан (монг. зайсан), и противопоставлялись рядовым скотоводам – харачы. Кроме чайзанов и харачы имелись и другие группы – кiстiмнер (кыштымы) и хул (рабы, княжеская челядь). Для решения важных дел чайзаны собирались на съезд (хурал). Иногда выделялись великие князья, которые за счёт авторитета могли претендовать на роль верховного предводителя и главнокомандующего (на сколько это было возможно на том уровне социально-политического развития). Судя по всему, улусы имели следующую стратификацию. Во главе улуса стоял наиболее знатный сеок – хыргыс (потомки древних енисейских кыргызов). Ниже него находились родственные кыргызам, или особо дружественные сеоки. Основную массу населения составляли преимущественно тюркоязычные сеоки различного происхождения (в т.ч. не кыргызского), нередко рассматривавшиеся как кыштымы (кiстiмнер) кыргызов. Каждый улус имел своих кыштымов, в него не входивших, и часто, имевших самодийское и енисейское (кетоязычны) происхождение.
Улусов было 4: Алтысарский (занимал северную, «нижнюю» часть Минусинской котловины - бассейн Чёрного и Белого Июсов и район Божьих озёр; в его состав входило много сеоков, позже вошедших в кызыльский субэтнос хакасов), Алтырский улус (располагался по левобережью р.Абакан от Уйбата до устья Таштыпа. Предки сагайцев, бирюсинцев, бельтиров), Езерский (располагался в центре Кыргызской землицы, вдоль Енисея от устья р.Абакан до р.Огур, на его основе позже сформировались хакасы-качинцы), Тубинский (занимал всё правобережье Енисея от Саян до р.Сыда, и правобережные степи Абакана. Предки хакасов-койбалов, которых сагайцы до сих пор именуют туба - наименее тюркский, населён в основном самодийцами). Основным видом хозяйствования было кочевое скотоводство. У окраинных, притаёжных племён имелось примитивное земледелие. Велика была роль охоты. С кыштымов кыргызы брали дань мехами и ремесленными изделиями (а им платили дань и "кузнецкие татары" - предки шорцев, населявших будущий Кузбасс).
Единства у кыргызов не было. Они брали дань со слабых соседей, но вынуждены были платить сами более сильным монголам и ойратам. Продвижение русских многие восприняли враждебно, т.к. те отбивали у них кыштымов, лишали источника дохода, да и с самих кыргызов требовали ясак и аманатов (заложников). Весь 17 в. наполнен постоянными войнами с кыргызами. Неоднократно в осаде оказывались русские остроги - Красноярский, Кузнецкий, Ачинский (его даже сжигали несколько раз) и др. Будущий Красноярск был прифронтовым пограничным городком! Кыргызы часто совершали набеги, угоняли скот, жгли деревни, убивали крестьян, служилых людей, уводили в плен ясачное население. Кыргызы имели собственное производство оружия, но значительная его часть поступала к ним от предков шорцев и северных алтайцев, известных своим кузнечным делом. Как отмечали русские, также использовавшие продукцию аборигенных ремесленников, «кузнецкие татары» производили панцири, шлемы, сабли, стрелы, всё, «опричь пищалей». Получали кыргызы вооружение и из соседних стран. Кыргызские матыры (батыры, т.е. дружинники князей, которые в общем насчитывали несколько тысяч человек) для защиты использовали шлемы, схожие с монгольскими, бригантины, кольчуги , металлические наручи и поножи среднеазиатского производства (или местные деревянные), круглые щиты. Основным наступательным оружием были лук и стрелы. Использовали также сабли, копья, топоры. Кыргызы стали использовать и огнестрельное оружие (полученное от ойратов, русских контрабандистов или трофейное). Несколько раз они наносили весьма ощутимые поражения даже небольшим российским "армиям" (по местным меркам), захватывая пушки и знамёна.
Долгое время кыргызы просили помощи у русских против монголов, пытались лавировать, но русские опасались большой войны с государством Алтан-ханов в Монголии. В 1667 г. последнее было разгромлено ойратами, что повысило престиж первых, и понизило престиж русских. Кыргызы окончательно перешли на сторону ойратов, и несколько десятилетий открыто и упорно враждовали с русскими и их союзниками. Особенно отличился в этом князь Алтырского улуса Ереняк (Иринек) Ишеев, который нанёс несколько серьёзных поражений царским воеводам, причинил большой ущерб и вообще усиливал напряжённость в отношениях между русскими и ойратами. Правитель ойратов Галдан никак не мог утихомирить своего младшего союзника. Однако Ереняк пал в 1688 г. в бою, когда отправился на помощь Галдану в его войне с монголами и империей Цин. Кыргызская землица была окончательно присоединена к России только в начале 18 в. Петровское правительство серьёзно взялось за продолжавших набеги кыргызов, и планомерно стало выбивать "сепаратистов". Новый ойратский правитель не желал портить с Россией отношения из-за кыргызов, не желал терять этих воинственных северян в случае продолжения русского наступления на среднем Енисее, да и пополнить войска Джунгарского ханства после провала войны Галдана было необходимо. Под конвоем ойратов кыргызы были выведены в основной массе в Джунгарию. Часть потом вернулась, но это были лишь сотни. Контролировавшиеся кыргызами земли были быстро заняты русскими. Оставшиеся кыргызы быстро ассимилировались со своими родственниками и кыштымами - как тюрко-язычными, так и самодийцами, образовав "инородческое" население Минусинского края, "минусинских татар", которые в начале ХХ в. стали именоваться хакасами (хагясами и харгясами в китайских летописях именуются енисейские кыргызы). После разгрома Джунгарского ханства остатки тамошних кыргызов маньчжуры и китайцы выселили на северо-восток империи, в Хэйлунцзян, где они и живут поныне (фуюйские кыргызы, наиболее близкородственные по языку и этнографии хакасам-сагайцам).
